Родился 27 января 1944 г. В 1961 г. окончил Большесосновскую среднюю школу Пермской области и поступил в Пермское ВАТУ, которое в 1962 г. было реорганизовано в Пермское ВКИУ. После выпуска из военного училища в 1966 г. служил в частях РВСН, в 1971 г. поступил в адъюнктуру Харьковского ВКИУ и в 1975 г., после утверждения ВАКом СССР степени кандидата технических наук вернулся в Пермское ВКИУ на должность преподавателя.
С 1979 г. — заместитель начальника кафедры, с 1984 г. — начальник кафедры, с 1991 г. — заместитель начальника училища по учебной и научной работе. Будучи начальником общеучилищной кафедры, возглавлял иследования проблем эксплуатации мобильных — грунтовых и железнодорожных — комплексов, а также проблем управления эксплуатацией для пространственно распределённых объектов. В 1985 г.награждён орденом «За службу в Вооружённых силах СССР» III степени. Начиная с 1991 г. стал инициатором и создателем в Пермском ВКИУ диссертационных советов по техническим наукам (кандидатский совет — с 1992 г., докторский совет — с 1996г.), а затем — по педагогическим наукам (кандидатский совет — с 1996 г., докторский — с 2000 г.), был Председателем Диссертационного совета по техническим наукам (1994 — 1996гг.), а затем — по педагогическим наукам — 1996 — 2003гг.) За годы с 1991 по 2003 Пермское ВКИУ — ПВИ РВ выросло в высококлассный центр подготовки инженеров для РВСН СССР — РФ. в вузе трудилось 56 докторов наук, 140 кандидатов наук. В этот период ежегодно проводились научно-технические и научно-методические конференции, связанные с ракетно-космической тематикой. В них участвовали учёные из вузов и НИИ со всей страны. За реализацию этих задач Трефилов В.А. награждён Орденом Почёта. Доктор технических наук, профессор Трефилов В.А. автор более 330 публикаций, в том числе — 24 учебника, учебных и методических пособий, автор 4 патентов на изобретения. На сегодняшний день Трефилов В.А. — научный консультант 5 докторов наук и научный руководитель 31 кандидата наук.
За вклад в науку Трефилов В.А. избран Действительным членом Российской академии Естественных наук, Российской академии космонавтики им. К.Э.Циолковского, Российской академии информатизации образования, Международной академии навигации и управления движением. Высококвалифицированные инженеры, специалисты в различных отраслях науки и техники, обученные и воспитанные при участии Трефилова В.А. составляют заметную долю профессионалов Перми и Пермского края. Трефилов В.А. — член диссертационного совета ПНИПУ. В связи с расформированием Пермского военного института ракетных войск и увольнением из Вооружённых сил в запас в 2003 году Трефилов В.А. перешёл на работу в Пермский государственный технический университет на должность проректора по учебной работе. Одновременно с этим, с 2005 года он — заведующий кафедрой. Кафедра стала лауреатом смотра-конкурса «Золотая кафедра России». В 2012 г. кафедра удостоена диплома Европейской научно-промышленной палаты «За системные исследования проблем безопасности», а Трефилов В.А. — Золотой Медали Европейской научно-промышленной палаты. Трефилов В.А. Продолжает активную научно-техническую и воспитательно-образовательную деятельность, в первую очередь в сфере обеспечения безопасности жизнедеятельности человека. Полковник в отставке Трефилов В.А. прослужил в Вооружённых Силах СССР и Российской Федерации 42 года. Проходя службу на различных должностях в частях Ракетных войск стратегического назначения, а также после увольнения в запас, Трефилов В.А. уделял и уделяет большое внимание профессиональному, техническому обучению и патриотическому воспитанию воинов, курсантов военного училища и института, молодёжи. В настоящее время, будучи членом Совета ветеранов Пермского военного института ракетных войск и патриотом Пермского края, активно участвует в пропаганде военной службы по защите Отечества.